En Whistleblower, adoptarás el papel de Waylon Park, un ingeniero informático que trabaja para Murkoff y que, al comienzo de Outlast, se puso en contacto mediante correo electrónico con periodistas de todo el mundo (Miles incluido). Tras un par de semanas en Mount Massive, durante las que no pudo comunicarse con su mujer e hijo debido a los estrictos protocolos de seguridad, Waylon empezó a desconfiar profundamente de los científicos y médicos a los que el ansia de lucro llevó a realizar experimentos peligrosos e irresponsables con los pacientes. La ira de Waylon aumentó al sentirse identificado con esos pobres desgraciados, y preparó el terreno para su plan de desenmascarar la corrupción que anidaba en Mount Massive.

Aunque Whistleblower narra la historia que condujo a Outlast, en realidad se remonta a los sucesos del primer juego, para así mostrar el capítulo final de la historia del Hospital psiquiátrico Mount Massive.